La France a assuré la présidence tournante de la Convention alpine de novembre 2006 à mars 2009. Elle a à ce titre organisé quatre comités permanents : Lanslebourg Mont Cenis (mai 2007), Bolzano (octobre 2007), Monaco (avril 2008) et Innsbrück (octobre 2008). Quatre thématiques prioritaires ont été travaillées lors de la présidence. Deux anciennes, les transports et les espaces protégés, sont poursuivies et deux nouvelles, le changement climatique et le tourisme durable, sont ajoutées.