Les volumes du registre indicateur constituent un index, classé par ordre alphabétique strict, des patronymes figurant dans la table alphabétique du répertoire. Très fréquemment utilisé, le registre indicateur a dû être refondu et recopié, de manière totale ou partielle, à plusieurs reprises. Les trois volumes de la série conservée pour le bureau d'Avallon ont été élaborés, semble-t-il, vers 1882. Pour effectuer des recherches, on utilisera cependant de préférence les volumes de la dernière série du registre indicateur du bureau d'Auxerre, qui contiennent, refondues au milieu du XXe siècle, l'ensemble des informations relatives aux bureaux d'Auxerre, d'Avallon et de Tonnerre. Les numéros associés à chaque patronyme renvoient aux volumes et feuillets de la table alphabétique du répertoire.