En 1965 est créée au sein du ministère de l’Agriculture une direction générale de l’espace rural, à laquelle sont rattachées la direction des forêts et la direction des aménagements ruraux. Cette organisation ministérielle rappelle le rattachement au début du siècle de la direction de l’hydraulique agricole à la direction générale des Eaux et Forêts. En mars 1968, la direction des aménagements ruraux est à nouveau rattachée directement au niveau ministériel. Entre 1965 et 1987, date de la création de la direction de l'espace rural et de la forêt, la direction des aménagements ruraux est chargée de missions qui évoluent assez peu : aménagement du territoire rural, équipement rural collectif et individuel, et pour l’hydraulique agricole, la gestion, la police et l’aménagement des cours d’eau relevant du ministère de l’Agriculture, l’aménagement et l’utilisation agricole des eaux, les travaux d’hydraulique agricole. Les années 1970 représentent toutefois un tournant dans la prise en compte des questions environnementales dans les politiques publiques, avec par exemple la création en 1971 du premier ministère de l’Environnement. Le ministère de l’Agriculture, en tant que gestionnaire historique des territoires ruraux et donc de la nature, voit lui aussi ses missions évoluer dans le sens d’un affichage de la prise en compte de l’environnement. En avril 1970, la direction de l’aménagement rural et des structures est placée en lien pour l’hydraulique avec la Mission interministérielle de l’eau et le Comité national de l’eau. Le décret portant réorganisation de l’administration centrale du ministère précise également ses missions de traitement des ordures ménagères et évacuation des eaux usées, ou encore de gestion des abattoirs publics, et d’utilisation de l’énergie en agriculture. Enfin, en 1976, les textes officiels précisent son rôle dans la mécanisation et motorisation de l’agriculture, dans la politique générale de l’eau sous tous les aspects intéressant le domaine agricole et rural, et pour une meilleure utilisation des sols.