Les douze missions du Levant comprenaient celles de Grèce, dont le supérieur résidait à Constantinople, et celles de Syrie (incluant celle d'Égypte), dont le supérieur résidait à Tripoli. Elles étaient installées à Galata (Constantinople), Chio, Salonique, Naxie, Santorin, Smyrne, Alep, Damas, Tripoli, Antoura, Saint-Élie dans l'« anti-Liban », Le Caire. Celles de Perse et de Crimée y étaient ponctuellement associées.La première mission fut fondée par les Jésuites à Galata en 1583. La mission de Smyrne, desservie aussi par les Capucins, servait de point d'embarquement pour les îles.