Les travaux d’étude sur les lacs du massif jurassien s’inscrivent dans le cadre de la mise en œuvre d’une politique régionale de protection et de restauration de la qualité des eaux du bassin de l’Ain, qui comprend notamment un volet destiné à la mise à jour des connaissances sur les principaux lacs du massif du Jura, les données les concernant étant très anciennes et très fragmentaires. Les diverses opérations ont été confiées au CEMAGREF (division Qualité des eaux), à l’université de Franche-Comté (laboratoire d’hydrobiologie et d’hydro-écologie), au laboratoire vétérinaire départemental du Jura et au SRAE de Franche-Comté, qui assurait le pilotage du programme.

Ce travail a été précédé par les monographies des lacs de Saint-Point et de Remoray (Doubs) en 1979, et du lac de l’Abbaye (Jura) en 1982.