Le sous-fonds  s'organise comme suit : *Orientation et programmation de la coopération, *Activités d'uatres organismes français, *Fonctionnement de la mission, assistance technique, *Les Seychelles et leurs partenaires, *Projets sur crédits déconcentrés d'intervention, *Aménagement du territoire, *Economie et finances, *Environnement et développement rural, *Insfrastructures et urbanisme, *Energies, mines et industries de transformartion, *Enseignement, culture et recherche, *Santé et développement social.

 

  * le développement de la pêche thonière ;

* les infrastructures en particulier les ports, l'équipement naval et la mise en place d'une brigade hydrographique ;

* l'énergie et les industries de transformation ;

* l'enseignement et la diffusion de la langue française ;

* la formation, dans le domaine maritime en particulier. Les bourses, dont le volume croit au fil des années, témoignent aussi de l'importance accordée à la formation en français ;

* la coopération dans le domaine culturel et la mise en valeur de langue et de la culture créoles ;

* les médias : presse, radio et télévision ;

* la recherche scientifique ;

* la santé ;

* la jeunesse et le sport, avec en particulier l'aide apportée pour l'organisation des Jeux de l'Océan indien.