Le fonds comporte des pièces non originales mais copiées par un tiers. Ceci est surtout vrai pour la correspondance qui se présente extrêmement souvent sous forme de registres, ainsi que pour certains documents personnels repris après la mort de l'amiral. Notons ici que plusieurs pièces manuscrites sont difficilement déchiffrables. Un dossier relatif à l'Empereur Napoléon Ier est communiqué par le comte de Las Cases à l'amiral Baudin. Il contient des mémoires et souvenirs ainsi que de la correspondance.

Un complément est donné en juin 2016. Il contient de la correspondance reçue et envoyée par l'amiral Baudin et sa famille ainsi qu'une collection d'autographes de marins et de militaires.