Le plan de classement tente de refléter au mieux l’activité et les missions de Pierre Marie. Le fonds regroupe d’abord une importante correspondance classée par origine géographique puis alphabétique des scripteurs. Il conserve ensuite quelques papiers personnels de Pierre Marie puis un important ensemble de travaux de recherche, publiés ou non, avec notamment un ensemble réunissant des recherches sur les foraminifères, domaine dans lequel Pierre Marie s’est particulièrement investi. Les dossiers de travail relatifs aux publications ont été regroupés par ordre chronologique de parution. Le fonds fait également état de l’activité de Pierre Marie au sein du Bureau de recherches et de Participations Minières de Rabat puis du Bureau de Recherches Géologiques, Géophysiques et Minières. Dans ce dernier établissement, Pierre Marie a mené de nombreuses études en tant que chef du Laboratoire de Micropaléontologie dont les travaux et notes préparatoires sont conservés ici. Quelques dossiers rendent compte de son insertion dans le milieu académique et sa participation à la vie de sa communauté scientifique. Enfin, le fonds conserve les papiers d’Eugène Lacroix, associés à la collection de ce médecin lyonnais (frère du minéralogiste Alfred Lacroix, professeur du Muséum) dont Pierre Marie a collecté les spécimens.