Les archives d'André Jeannet déposées reflètent ses passions : la spéléologie, l'archéologie et l'histoire. C'est au cours de ses activités aux Auberges de Jeunesse, avant la Seconde guerre mondiale, qu'André Jeannet a découvert la spéléologie. Après la guerre, il est un membre actif de la Société de recherches spéléologiques de la Haute-Mouge. Dans le domaine de l'archéologie préhistorique, André Jeannet a suivi un stage de formation à Arcy-sur-Cure avec André Leroi-Gourhan. Il a ensuite fouillé plusieurs sites préhistoriques de Saône-et-Loire : Azé, Vergisson, Jugy, Blanot et Varennes-lès-Mâcon. Soucieux de fédérer l'activité archéologique en Saône-et-Loire, il crée le Groupement archéologique mâconnais en 1953, avec l appui de Marcel Vitte, puis est à l'origine du Comité départemental de la recherche archéologique de Saône-et-Loire en 1968, avec Jean Combier.

Le fonds André Jeannet éclaire par ailleurs les origines du site touristique des grottes d'Azé. L'importance des découvertes faites lors de l'exploration des grottes d'Azé au cours des années 1950 avait conduit Raymond Morel, président de la société de la Haute-Mouge, à fonder en 1963 une nouvelle association, Loisirs et Culture, dont l'objet était d'aménager et exploiter le site d'Azé. André Jeannet a présidé Loisirs et Culture de 1970 à 1978 avant d'en démissionner.

Les recherches conduites sur Azé par André Jeannet ont débouché sur une synthèse, publiée en 1992. Le "Glossaire du langage populaire de Saône-et-Loire" a été réalisé à partir des dépouillements d'archives, notamment notariales, faits par André Jeannet ; il a repris de son métier d'informaticien le principe d'un "masque de saisie" normalisé pour recenser les termes retenus, comme le montrent les classeurs conservés sous la cote 107 J 11 et 12.