Les archives anciennes de la Bergerie nationale de Rambouillet ont été classées selon le plan suivant :

La partie Gestion de l’établissement regroupe les archives papiers touchant au fonctionnement de la Bergerie depuis la Révolution jusqu’aux années 1970, et parfois au-delà par exception. Elle est exhaustive jusqu’en 1925, et ne comprend pour les années postérieures que des dossiers épars : le reste se trouve à la Bergerie dans un local d’archivage courant et intermédiaire.

Deux grands ensembles ont été dégagés. Les articles 1 à 167 sont formés de dossiers annuels allant de 1789 à 1925 inclus. Ces dossiers ont été formés ainsi à la Bergerie et étaient conservés individuellement dans des boîtes cartonnées vertes. Ce classement a été respecté. Chaque année, sont ainsi regroupés la comptabilité, la correspondance (arrivée et/ou départ, parfois subdivisée entre correspondance administrative et commerciale, ou entre tutelle ministérielle et particuliers), et des dossiers annuels sur le suivi du personnel, du troupeau, des élèves, et des événements ou dossiers particuliers. Chacun de ces sous-ensembles n’est pas toujours présent chaque année, d’où de grandes disparités entre les périodes ; il faut de ce point de vue noter de grandes lacunes pour la fin de la Restauration et la Monarchie de Juillet, et un accroissement significatif des liasses à partir des années 1850 et plus encore à partir des années 1900. Enfin, le suivi d’une affaire sur plusieurs années explique parfois l’existence dans un dossier donné de documents antérieurs ou postérieurs à l’année en cours.

Les articles 168 à 609 ont été classés méthodiquement à partir de dossiers en vrac ou constitués par tel ou tel directeur, et dont la logique archivistique (respect du fonds) comme la composition (par exemple l’existence de registres, qui plus est pluriannuels) interdisaient l’intégration aux dossiers annuels. Ils traitent de toute l’administration de l’établissement de 1793 à 2005, chaque sous-ensemble présentant une périodisation et une ampleur variable : administration générale (art. 168-170) (1898-1948) ; correspondance de la direction (art. 171-213) (1803-1950) ; relations extérieures (art. 214) (1864-1962) ; relations internationales (art. 215-218) (1842-1949) ; comptabilité (art. 219-321) (1793-1954) ; gestion de l’approvisionnement, de la production et des biens (art. 322-387) (188-1956) ; gestion du domaine (art. 388-411) (1804-1971) ; gestion du personnel (art. 412-420) (1852-1968) ; gestion des troupeaux (art. 421-511) (1793-2005) ; enseignement (art. 512-608) ; notes informes et brouillons sur la gestion de l’établissement (art. 609).

Pour toute recherche, il est donc indispensable de croiser les apports de chacun de ces deux ensembles.

La partie Documents figurés regroupe les pièces figurées hors photographies : portraits, peintures, gravures, cartes, plans, affiches, diplômes, cartes postales. L’ensemble est classé par objet et support. Il faut noter la très grande diversité de supports et de dates de cette partie qui s’apparente plus à une collection qu’à un véritable sous-fonds archivistique. Se détachent dans cette partie la série d’aquarelles de mérinos peintes au tournant du Directoire et du Consulat, ainsi que leur déclinaison en gravures sur cuivre (matrices et tirages), deux clichés encadrés de mérinos pris par Félix Tournachon dit Nadar en 1855, et deux autres photographies encadrées de mérinos prises par le photographe de la Maison de l’empereur en 1866.

La partie Photographies est constituée de tous les supports photographiques du fonds, sauf rares exceptions de photographies intégrées dans des dossiers papiers qui y ont été laissées par respect du fonds, et des quelques clichés encadrés qui ont été classés dans la partie Documents figurés. Des milliers de photographies de tout support ont été versées : positifs, négatifs, planches contacts, sur support souple, sur support cartonné, sur plaques de verre. Elles sont réparties en trois ensembles :

Dans la quatrième partie ont été regroupés les objets versés avec le fonds d’archives : statue, tableaux d’échantillons de laine, outils zootechniques.

La cinquième partie dite Documentation ne comporte qu’un article, regroupant des documents archivistiques épars relatifs à l’histoire de la Bergerie, du mouton et de la laine.

Enfin, une sixième partie intitulée « Autres fonds » regroupe à la fin du versement des articles issus d’autres producteurs que la Bergerie : plans de la ferme du Pré-aux-Rats (Seine-et-Marne), dont le lien avec Rambouillet est inconnu à ce jour, autres activités des directeurs de la Bergerie, et fonds de l’Association pour l'organisation du bicentenaire de la Bergerie nationale et de la 2e conférence mondiale du mérinos. Ce dernier fonds n’est manifestement constitué que de bribes des archives produites par cette association éphémère dédiée à l’organisation d’événements tenus respectivement en 1986 et 2010.